產品簡介
普通轉錄組測序就是對特定物種或者特定細胞在某一功能狀態下產生的所有mRNA進行的測序。將生物樣本中的RNA反轉錄為cDNA,構建測序文庫,利用二代測序平臺得到序列,進行生物信息學分析;全面快速地獲得某一物種特定組織在某一狀態下的所有轉錄本。


技術路線
注:真核生物采用Oligo dT磁珠富集法,原核生物采用去rRNA法來富集mRNA。


技術優勢

檢測不受物種限制
不依賴于參考基因組,對于無參基因組的物種也可以進行轉錄組測序以及后續分析

檢測范圍廣泛
可直接對任意物種進行轉錄組測序,可以同時鑒定己知的、稀有低豐度的和新的轉錄本

高質量數據產出
實驗過程中嚴格按照質控標準,保證數據可靠性。測序結果精確到單個堿基,可檢測到由可變剪切造成的單個堿基差異。

資深的生信分析團隊 
測序數據可被用來分析基因表達差異,基因功能分析以及鑒定新的轉錄木信息以及個性化分析

優質的一站式股務
專業的技術團隊為您提供1V1的一站式服務,讓您時刻了解項目動態。 


測序策略


樣本要求


數據分析
根據測序物種有無參考基因組可以分為有參轉錄組測序和無參轉錄組測序。分別可以得到的生信分析如下:

有參轉錄組測序生信分析



無參轉錄組測序生信分析

部分數據展示

組間的差異基因Venn 圖

差異表達基因聚類熱圖

樣品PCA 分析圖


差異基因GO Terms 富集結果top20 散點圖


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服務周期:樣本質控合格后30個工作日


相關文獻

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[2]Kundu Anirban,Singh Pankaj Kumar,Dey Avishek,Ganguli Sayak,Pal Amita. Complex molecular mechanisms underlying MYMIV-resistance in Vigna mungo revealed by comparative transcriptome profiling.[J]. Scientific reports,2019,9(1).

[3]Yan Yong-Wei,Zou Bin,Zhu Ting,Hozzein Wael N,Quan Zhe-Xue. Modified RNA-seq method for microbial community and diversity analysis using rRNA in different types of environmental samples.[J]. PloS one,2017,12(10).

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